miércoles, 4 de mayo de 2016

C.D ANA GRACIELA PÉREZ V. "GENÉTICA MÉDICA"



Módulo: Seminario Monográfico Multidisciplinario
Alumna: Ana Graciela Pérez Vázquez
Profr: Mtro. José Luis Uribe Piña
Ponente: C.M.F Agustín Tiol Morales
“GENÉTICA MÉDICA”

GENÉTICA MÉDICA
La Genética médica es la aplicación de la genética en el contexto de la medicina. El campo de aplicación de la genética médica es amplio y variado. Incluye diferentes áreas individuales tales como la genética clínica, la genética bioquímica, la genética molecular, la citogenética, la genética de enfermedades comunes y el consejo o asesoramiento genético.
Cualquier otra área de la genética médica se considera un híbrido de los anteriores. Por ejemplo la genética clínica es un híbrido de la medicina clínica y la genética. La genética bioquímica es un híbrido de la bioquímica y la genética y en ésta se incluye el estudio de cromosomas bajo el microscopio. La consejería genética es un híbrido de la genética con la consejería no direccional.
HISTORIA
A pesar de que la genética tiene sus raíces desde el siglo XIX con el trabajo de Gregor Mendel, fue extensamente estudiada en relación a un número importante de desórdenes tales como el albinismo, braquidactilia y hemofilia. Durante su período de desarrollo se elaboraron varios enfoques matemáticos y se relacionaron con la genética humana, a partir de estos descubrimientos surgió la genética de poblaciones.
La genética médica se considera como un desarrollo tardío, emergió fundamentalmente después de la Segunda Guerra Mundial (1945) cuando los movimientos eugénicos perdieron crédito. El mal uso nazi del concepto de eugenesia fue la gota que derramó el vaso. Sin tomar en cuenta la eugenesia, se pueden considerar y aplicar diferentes enfoques que permiten mejorar la calidad de vida y la salud de los seres humanos. La genética médica alcanzó un alto nivel de importancia en la segunda mitad del siglo XX y continúa con mayor impulso en el siglo XXI.
INTRODUCCIÓN
 Las enfermedades genéticas constituyen un problema de salud de primer orden en general y, en particular, en nefrología, al representar una causa importante de morbimortalidad. Las anomalías congénitas renales y del tracto urinario constituyen el 20-30% de todas las anomalías identificadas en el neonato, ocurren en 1-3 de cada 500 recién nacidos y son la causa de hasta el 50% de los casos de fallo renal en la infancia. Los factores genéticos desempeñan un papel predominante en aproximadamente un tercio de los trastornos crónicos en la edad adulta. Se estima que el 10-20% de los adultos con enfermedad renal crónica tienen una enfermedad genética hereditaria de base, aunque esta cifra se considera muy inferior a la real ya que las enfermedades genéticas subyacentes están infradiagnosticadas. Las enfermedades genéticas se consideran en su mayoría enfermedades raras (ER) por su baja prevalencia individual. Las ER suelen ser difíciles de diagnosticar y actualmente son prioritarias en salud pública y en investigación.
Las enfermedades genéticas pueden ser cromosómicas, monogénicas o multifactoriales. Las enfermedades renales hereditarias más conocidas son las monogénicas, por alteración de un solo gen, pero las más frecuentes son las complejas, como las nefropatías asociadas a la hipertensión, a la diabetes o a las enfermedades autoinmunes. En estas enfermedades consideradas multifactoriales o complejas, se heredan varios alelos de genes diferentes que proporcionan un riesgo genético o predisposición individual a su desarrollo, manifestándose sólo en ciertas condiciones ambientales. Actualmente la epigenética intenta explicar las interacciones génicas y ambientales y estudia los cambios en la expresión génica mediados por mecanismos diferentes a los cambios de secuencia de sus nucleótidos. Estos cambios epigenéticos incluyen la metilación del ADN, la modificación de las histonas y el ARN de interferencia. Las alteraciones epigenéticas se asocian con inflamación y enfermedad cardiovascular en pacientes con enfermedad renal crónica. Los resultados de la investigación del papel de estos cambios sobre el proceso de enfermedad podrían ser muy valiosos en el diseño de estrategias terapéuticas futuras. 
La genética médica (GM) se define como la especialidad médico-sanitaria que aplica los conocimientos de la genética a la práctica médica, ocupándose de las enfermedades de origen genético, incluyendo patologías hereditarias y malformativas de la especie humana. El campo de acción de la GM son los individuos afectados por enfermedades genéticas y sus familias, incluyendo los aspectos diagnósticos (clínicos y de laboratorio), pronósticos, preventivos y de tratamiento de las distintas patologías, así como los aspectos éticos, legales y sociales de la genética. Las acciones abarcan no sólo desde la etapa preconcepcional hasta el fallecimiento del individuo, sino también el seguimiento intergeneracional.
La GM proporciona los conceptos fundamentales de la genética a los procesos vitales básicos, cohesiona la práctica médica y está reconocida como especialidad en la mayoría de los países desarrollados. España junto con Grecia son los dos únicos países de Europa donde no se reconoce. Últimamente se están produciendo avances en este sentido y es deseable que en los próximos años esta situación quede definitivamente resuelta. 
El Proyecto Genoma Humano, finalizado a comienzos de este siglo, está permitiendo una mejor aproximación a las enfermedades a través del desarrollo progresivo de herramientas diagnósticas, de medidas preventivas y más lentamente de estrategias terapéuticas. Actualmente existe una apreciación creciente del papel de la epigenética en la regulación de la expresión génica y el origen de la enfermedad que ha dado lugar al Proyecto Epigenoma Humano. Los avances en genética se suceden a un ritmo muy rápido y los genetistas clínicos lo deben tener en cuenta para aplicarlo a la práctica médica adecuadamente. Es necesaria la colaboración estrecha con los laboratorios de citogenética, genética molecular y bioquímica, así como la conexión con otras especialidades médicas, ya que las enfermedades genéticas son multisistémicas y pueden aparecer a cualquier edad.
Muchas de las enfermedades genéticas se manifiestan a través de síndromes polimalformativos o dismórficos donde el papel del médico genetista es clave para su reconocimiento a través de las habilidades desarrolladas en dismorfología, término acuñado por David W. Smith en 1960. La dismorfología se ocupa del estudio de las malformaciones congénitas humanas. Como disciplina científica, combina conceptos, conocimientos y técnicas de embriología, genética clínica y pediatría, con el objetivo de reconocer distintas enfermedades genéticas por la combinación característica de sus manifestaciones clínicas (síndromología). El tratado clásico que recopila los distintos rasgos clínicos de los síndromes malformativos más frecuentes y su etiología  (Smith´s Recognizable Patterns of Malformation Syndromes), ya en su sexta edición, es un libro básico de consulta en este ámbito11. En los últimos 10-15 años se han desarrollado además, distintas bases de datos informatizadas como herramientas de apoyo al diagnóstico sindrómico: London Dysmorphology Database, Possum y la que proporciona de forma pública Orphanet, entre otros.
El avance en la capacidad diagnóstica no ha ido paralelo al desarrollo terapéutico en las enfermedades genéticas. El tratamiento ha sido, en gran parte, sustituido por su adecuado manejo y seguimiento, aspecto fundamental para mejorar la calidad de vida y disminuir la morbimortalidad asociada. En los últimos años, se están produciendo avances muy importantes en el tratamiento de algunas enfermedades genéticas, principalmente metabólicas, como la Enfermedad de Fabry.
La evolución de la genética desde la década de 1960 hasta nuestros días se refleja en el Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), catálogo público, actualizado periódicamente y disponible en Internet, sobre los genes humanos y las enfermedades genéticas, de extraordinaria utilidad para el médico genetista.
Un aspecto muy importante en la práctica médica genética es el asesoramiento genético (AG). El AG es un proceso de comunicación, no directivo, en el que se informa del riesgo de producción de un defecto congénito o enfermedad genética en un individuo, pareja o su familia, de la forma en que este riesgo puede evitarse o minimizarse y, en caso de producirse, cómo mejorar su pronóstico18. Este proceso es de una importancia creciente en la medicina moderna y debe ser un acto sanitario de categoría superior que, siempre que sea posible, debe proporcionarse por personal especializado en este campo19. Para ofrecer un asesoramiento genético correcto se debe partir de un diagnóstico exacto que conlleva una anamnesis cuidadosa, una evaluación clínica y complementaria adecuada y una historia familiar exhaustiva de al menos tres generaciones (árbol genealógico) y exige tomar el tiempo adecuado para cumplir con cada uno de los componentes implícitos de este proceso. Además, es necesario conocer las peculiaridades inherentes a cada situación específica, como la etapa prenatal o la posnatal, y en esta última el diagnóstico en un niño o adulto, el diagnóstico de portadores, el diagnóstico presintomático o de predisposición. Tener en cuenta todos estos factores precisa una alta especialización, además de habilidades de comunicación y respeto por las normas éticas vigentes y las diferentes culturas. El respeto a la autonomía en las opciones reproductivas es la piedra angular en la ética del asesoramiento genético.

De cara al futuro, la genética está experimentando un desarrollo extraordinario desde su visión fenotípica a la genotípica o molecular, promoviendo la importancia del pronóstico y la predicción (transición de la genética médica a la medicina genética o genómica). Estos avances se irán transfiriendo a la atención sanitaria médica, y la salud pública tendrá que integrarlos en sus medidas preventivas20. La posibilidad de analizar los genomas de los individuos se acompaña del riesgo del mal uso y abuso de la información. El genetista clínico tiene el privilegio de vivir de cerca todos estos avances científicos señalados, pero también la responsabilidad de proteger los datos y velar por mantener el derecho individual de la no discriminación por causa genética.
MENDELISMO
Las enfermedades genéticas monogénicas que siguen el patrón de herencia clásico descrito por Mendel (1865) se denominan mendelianas. Un trastorno monogénico es el que está determinado por los alelos de un solo locus génico. Los alelos son las distintas copias de un gen o las variantes alternativas de la información genética en un determinado locus. Cuando los dos alelos de un determinado locus son idénticos, se dice que el individuo es homocigoto y cuando son distintos es heterocigoto.
Los modelos clásicos de herencia mendeliana van a depender básicamente de dos factores: a) la localización cromosómica del locus génico, pudiendo ser autosómico, si está localizado en uno de los 22 pares de autosomas, o ligado a X, si está localizado en el cromosoma X, y b) las características del fenotipo, si es dominante (la presencia de un solo alelo mutado en el gen es suficiente para que la enfermedad se manifieste) o recesivo (se expresa solo cuando ambos alelos están mutados). Así vamos a obtener los diferentes patrones de herencia mendeliana: autosómico o ligado al X, dominante o recesivo21-24. No se ha descrito ninguna enfermedad renal con herencia ligada al cromosoma Y.
La elaboración de un árbol genealógico permite identificar en muchos casos un patrón de herencia monogénico que va a ser de gran ayuda en la orientación diagnóstica de muchos pacientes. Para su interpretación hay que tener en cuenta determinados factores que modifican la expresión clínica y transmisión de algunas enfermedades18, así como los modelos atípicos de herencia que no se ajustan a los patrones clásicos de herencia mendelianos (impronta genómica, disomia uniparental, expansión de tripletes, herencia digénica, mosaicismo). Para la realización del árbol genealógico se utilizarán los símbolos estándar, de acuerdo con las recomendaciones de los profesionales en el campo del asesoramiento genético23,26
Herencia autosómica dominante
Este tipo de herencia corresponde a más de la mitad de los trastornos mendelianos en general, y se suelen expresar con frecuencia en la edad adulta. La enfermedad renal mendeliana más frecuente es la poliquistosis renal autosómica dominante27, que afecta a 1/1.000 individuos2.
El patrón de herencia autosómica dominante se caracteriza por:
1. Transmisión vertical, al tener miembros afectados en cada generación (salvo en mutaciones de novo).
2. Un riesgo para cada afectado del 50% de transmitir la enfermedad a su descendencia.
3. Afectación por igual de hombres y mujeres (existe transmisión hombre-hombre).
Los factores que pueden modificar la expresión clínica de las enfermedades dominantes y dificultar su reconocimiento son:
1. Penetrancia. Probabilidad de que un gen mutado tenga expresión fenotípica. Es el porcentaje de personas con un genotipo mutante determinado que están afectadas. Si es del 100% se dice que es completa y todo el que recibe el alelo mutado estará afectado de forma más o menos grave (p. ej., esclerosis tuberosa); si es menor del 100%, es incompleta y en este caso puede haber individuos con la mutación, no afectados, que puedan transmitirla a su descendencia (p. ej., en el síndrome hemolítico-urémico atípico asociado a mutaciones en los genes CFH, CFI, MCP y FB, en el que se estima una penetrancia del 50%).
2. Expresividad. Gravedad de la expresión fenotípica. Si personas con el mismo genotipo presentan distinta gravedad se dice que hay expresividad variable. La expresividad variable de la esclerosis tuberosa obliga a buscar signos menores en los progenitores de los individuos afectados para intentar detectar fenotipos más leves que puedan pasar desapercibidos.

3. Inicio de los síntomas. Puede ser muy variable para algunas enfermedades y es muy importante conocer ese período en cada caso a evaluar. Así, algunos pacientes con poliquistosis renal autosómica dominante pueden no presentar quistes en la ecografía hasta la tercera década3
4. Mutaciones de novo. Una mutación de una enfermedad dominante puede ocurrir en un individuo de novo, sin tener ningún progenitor afectado, y transmitirse de forma dominante a partir de él a las generaciones posteriores. Dos tercios de los pacientes con esclerosis tuberosa y el 10% de los pacientes con poliquistosis renal autosómica dominante son el resultado de mutaciones de novo3.
5. Pleiotropía. Un gen produce efectos fenotípicos diversos, como afectación de varios sistemas u órganos y aparición de diferentes signos o síntomas, por ejemplo, en el síndrome de Marfan se produce una afectación esquelética, cardíaca y ocular.
Herencia autosómica recesiva
La enfermedad autosómica recesiva se produce en individuos con los dos alelos de un gen mutados. Habitualmente el afectado ha heredado un alelo mutado de cada progenitor (portadores obligados).
Se caracteriza por:
1. Los progenitores del afectado son portadores sanos de la mutación.
2. Transmisión horizontal, es decir, si aparece más de un individuo afecto en la familia, se suele producir en hermanos del probando.
3. El riesgo de recurrencia de la enfermedad en cada hermano del probando es del 25%.
4. Los hombres y las mujeres tienen la misma probabilidad de estar afectados.
Las enfermedades recesivas suelen manifestarse más precozmente, incluso en la etapa prenatal o en la infancia y adolescencia, y presentan penetrancia completa.
Algunas de las enfermedades renales que siguen este patrón son la cistinuria, cistinosis y nefronoptisis; esta última es la causa genética más frecuente de enfermedad renal crónica en las tres primeras décadas de la vida, asociada a mutaciones en 9 genes hasta la fecha (de NPHP1 a NPHP9)2
Es muy importante para el asesoramiento genético de una enfermedad autosómica recesiva conocer la frecuencia de portadores de una enfermedad en la población. Otros factores que deben considerarse son la consanguinidad y la endogamia, que aumentan la probabilidad de que los miembros de una pareja sean portadores de un alelo mutante en el mismo locus.
Herencia ligada al X
En este tipo de herencia debemos recordar que los hombres son hemicigotos para los genes del cromosoma X, ya que solamente tienen un cromosoma X, y las mujeres tienen dos.
Es importante también conocer el fenómeno de la inactivación del X, que se refiere a la inactivación al azar de uno de los cromosomas X de la mujer durante la primera semana del desarrollo. El X inactivo puede ser el paterno o el materno de forma aleatoria, pero permanente. La proporción de células con el gen mutado activo es, por tanto, variable. Este fenómeno justifica la expresión variable de los fenotipos ligados a genes del cromosoma X en mujeres heterocigotas, como ocurre en la enfermedad de Fabry. Otras enfermedades renales con patrón ligado al X son el síndrome de Alport o la enfermedad de Dent28.
Las características de la herencia ligada a X son (figura 2c):
1. La incidencia del rasgo es mucho mayor en hombres.
2. El hombre transmite el alelo mutado a todas sus hijas.
3. No hay transmisión hombre-hombre.
4. Puede haber transmisión generacional por mujeres portadoras, los hombres afectados estarán emparentados siempre a través de mujeres.
5. Las mujeres heterocigotas pueden mostrar una clínica variable (según el grado de inactivación del X)
GENÉTICA POBLACIONAL
La genética de poblaciones es el estudio de la distribución de los genes en las poblaciones y de la manera en que las frecuencias de los genes y de los genotipos se mantienen o cambian. Se ocupa tanto de los factores genéticos (como la mutación y la  reproducción) y de los factores ambientales y sociales (como la selección y la migración) que conjuntamente van a determinar la frecuencia y distribución de las enfermedades genéticas en las familias y en la comunidad21.
La especie humana tiene más de 6.000 millones de individuos, que pueden subdividirse en subpoblaciones o grupos étnicos. Aunque los 25.000 genes, y sus localizaciones y orden de los cromosomas presentes en la población humana son idénticos en todos los seres humanos, existen pequeñas variaciones en la secuencia de ADN entre individuos de una determinada población22. La mayoría de las variaciones se dan en todas las poblaciones humanas con frecuencias similares, mientras algunas variantes alélicas están restringidas a determinadas poblaciones, aunque no por eso están presentes en todos los individuos de ese grupo. Estos alelos que presentan variaciones en la frecuencia entre distintas poblaciones pueden ser marcadores genéticos neutrales desde el punto de vista de la selección, proporcionando un modo de trazar la historia humana mediante el seguimiento de las fluctuaciones de los genes, o ser alelos causantes de enfermedades genéticas, un ejemplo de estos es la mayor frecuencia de portadores del alelo de riesgo en el locus MYH9 asociado con el desarrollo de glomeruloesclerosis segmentaria focal en los americanos de EE.UU. de origen africano (60%) frente a los de ascendencia europea (4%). Las variaciones poblacionales causantes de enfermedad son de gran importancia, ya que confieren diferentes niveles de riesgo de contraer enfermedades genéticas en grupos específicos de población (el riesgo de presentar glomeruloesclerosis segmentaria focal es cinco veces mayor en los americanos de origen africano que en los de origen europeo).
En genética de poblaciones debemos hablar del índice de heterocigosidad. Este índice promedio para el ADN genómico humano es de 0,0037, lo que quiere decir que una base de cada 270 varía entre dos individuos22. Muchos de estos cambios son de un solo nucleótido (Single Nucleotide Polymorphisms o SNP) y la mayoría son neutrales, ya que no originan ningún efecto fenotípico. Otros pueden comportarse como factores de riesgo de enfermedad o ser de por sí causa de enfermedad.
FRECUENCIAS ALÉLICAS EN LA POBLACIÓN. LEY DE HARDY-WEINBERG
Uno de los postulados centrales de la genética de poblaciones es la Ley de Hardy-Weinberg. Enuncia que las frecuencias genotípicas están determinadas por las frecuencias alélicas de la población y permanecen estables de generación en generación, siempre que la población sea grande, aislada y que los emparejamientos entre individuos se produzcan al azar29.
Así, para un rasgo autosómico recesivo debido a homocigosidad de un alelo mutante (a) que tiene una frecuencia q (alelo normal A con una frecuencia p), si éstos son los únicos alelos en el locus, la suma de p y q debe ser 100% o 1. De modo similar, la suma de las frecuencias del homocigoto normal (AA, frecuencia p x p o p2 ), del heterocigoto (Aa, frecuencia 2 x p x q o 2pq) y del homocigoto afectado (aa, frecuencia q x q o q2 ) debe ser del 100% o 1 (p2 + 2pq + q2 =1).
El exponente 2 de la fórmula binomial representa el par de alelos de cualquier locus autosómico o ligado al X en mujeres. La principal aplicación de esta ley en genética médica es la estimación de la frecuencia de portadores en la población general cuando se asesora genéticamente en una enfermedad autosómica recesiva. Por ejemplo, si la poliquistosis renal autosómica recesiva (ARPKD, OMIM# 263200)17 presenta una frecuencia (q2) de 1/10.000 en la población general, entonces q es la raíz cuadrada de esta cifra, o sea 1 en 100; p se aproxima a 1 (p = 1 - q = 0,99) y por tanto, la frecuencia de portadores (heterocigotos) en la población general es de 1 en 50 (2pq = 2 x 1/100 = 1/50).
Es frecuente en la práctica clínica diaria que un paciente adulto sano, con hermanos fallecidos afectados por una enfermedad recesiva, acuda a consulta para saber qué probabilidad tiene de tener hijos enfermos. Dado que la enfermedad se manifiesta de modo precoz y tiene una penetrancia del 100%, sabemos que el consultante no es homocigoto para la mutación, si bien puede ser portador heterocigoto (2/3 = 66,6%). Para su pareja, no consanguínea y sin antecedentes familiares de interés, el riesgo de ser portadora de la enfermedad es igual al de la población general (tomaremos 1/75 como media). De este modo podemos calcular la probabilidad que preocupa al consultante:
2/3 (riesgo de ser portador) x 1/2 (probabilidad de que siendo portador transmita el alelo mutante) x 1/75 (probabilidad de que la pareja del consultante sea portadora) x 1/2 (probabilidad de que siendo portadora su pareja transmita el alelo mutante) = 1/450 será el riesgo de tener hijos afectados en este caso30.
Existen una serie de factores que alteran el equilibrio Hardy-Weinberg:
1. Que la población sea pequeña, de manera que los acontecimientos al azar puedan alterar de manera radical una frecuencia alélica. En una población de tamaño reducido, efectos aleatorios, como el aumento de fertilidad o la supervivencia de portadores de una mutación, pueden originar que la frecuencia alélica se modifique de una generación a la siguiente. Este fenómeno se conoce como deriva genética29. Puede ocurrir en supervivientes de una catástrofe que actúan como repobladores de una población o por el efecto fundador donde unos pocos individuos migran hacia una zona previamente despoblada.
2. Que la población contenga subgrupos con emparejamientos no aleatorios, por estratificación (subgrupos con una relativa separación genética, como los indios americanos); por emparejamiento dirigido (por semejanza, p. ej., pareja con problemas médicos similares) o por consanguinidad/endogamia (por aislamiento genético, p. ej., judíos askenazíes o gitanos). El efecto genético global será un incremento de la proporción de genotipos homocigotos a expensas del heterocigoto.
3. Que existan inmigración y emigración de grupos con frecuencias alélicas diferentes a las de la población general. Esta difusión lenta de genes a través de una barrera (racial, cultural, geográfica) se denomina flujo génico.
4. La existencia de mutación y selección, si bien estos cambios en la frecuencia alélica suelen ser lentos, ocasionando desviaciones sutiles del equilibrio de Hardy-Weinberg29.

POLIMORFISMO GENÉTICO
 Cuando un alelo de un determinado locus está presenta en más del 1% de la población general se denomina polimorfismo genético22. La proporción total de posiciones en las que existen pares de bases polimórficas se ha estimado en alrededor de uno de cada 1.000 pares de bases de cualquier trozo de ADN del genoma elegido al azar. Existen diversos tipos de polimorfismos. Los SNP o polimorfismos de nucleótido único, mencionados previamente, están distribuidos a lo largo del genoma y son los más frecuentes, por lo que son excelentes marcadores para generar mapas genéticos. A través del proyecto Genoma Humano se han identificado más de 6 millones de SNP, catalogados en bases de datos accesibles21.
Los RFLP’s (Restriction Fragment Length Polymorphism) o polimorfismos del tamaño de los fragmentos de restricción son fragmentos variables de ADN generados tras el corte con una enzima de restricción que reconoce una secuencia específica de nucleótidos. Un cambio puntual en una diana de restricción puede alterar el tamaño de los fragmentos resultantes31. Son polimorfismos que presentan normalmente un número bajo de alelos y por lo tanto su utilización en el diagnóstico genético indirecto es limitada. El diagnóstico indirecto es independiente del conocimiento previo de la naturaleza molecular de la mutación a diagnosticar y para llevarlo a cabo solo es preciso conocer la localización cromosómica del locus implicado. Dicha estrategia consiste en estudiar, en la familia del probando, la segregación conjunta de la enfermedad y secuencias polimórficas físicamente próximas (ligadas) al locus de la misma. Otros polimorfismos son los VNTR (Variable Number of Tandem repeats) o polimorfismos  de repetición en tándem de número variable que se caracterizan por la inserción en tándem de múltiples copias de una secuencia de ADN.
Existen dos tipos: minisatélites y microsatélites. Los VNTR-minisatélites corresponden a secuencias de ADN de unas pocas decenas de nucleótidos repetidas en tándem (de 10 a 100 pares de bases).
No están distribuidos por todo el genoma y por lo tanto sólo pueden ser utilizados en el diagnostico de un número muy reducido de enfermedades y se han aplicado sobre todo a los estudios de paternidad. Estos marcadores han sido superados por los VNTR-microsatélites (más frecuentes y polimórficos). Corresponden a la repetición en tándem de secuencias de entre 2 y 5 nucleótidos. Los microsatélites están distribuidos de forma casi homogénea por todo el genoma y presentan un número elevado de alelos con frecuencias similares entre sí, de forma que la probabilidad de que un individuo sea heterozigoto es muy elevada (presentan una alta heterozigosidad, superior al 70%). Su detección se realiza normalmente mediante la técnica de PCR o reacción en cadena de la polimerasa, básica en genética molecular. Son por excelencia los marcadores utilizados en el análisis de ligamiento genético. Los diferentes alelos de los marcadores polimórficos en un segmento cromosómico o en un gen forman el haplotipo, que se hereda en bloque a través de generaciones.
En el estudio genético indirecto o de ligamiento se identifica el haplotipo de riesgo asociado a la enfermedad en una determinada familia; no identifica las mutaciones de un gen. En la poliquistosis renal autosómica dominante se aplica este tipo de estudio para conocer si el haplotipo de riesgo en la familia está ligado al gen PKD1 o PKD2.

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